INTENDENTES DE 1892 A 1907
José da Silva Baptista, de10 de março a 21 de abril de 1892 (presidente da junta administrativa da Vila de Santana das Antas até a eleição do intendente); Theodoro da Silva Batista, de 21 de abril a 25 de maio de 1892 (intendente nomeado); Alexandre Batista Arantes, de 25 de maio de 1892 a 24 de março de 1893 (intendente nomeado); Lopo de Souza Ramos, de 24 de março de 1893 a 21 de maio de 1895 (intendente eleito), Antônio Pereira de Sousa Dutra, de 21 de maio de 1895 a 9 de julho de 1897 (intendente eleito); Manuel Francisco d´Abadia, de 9 de junho de 1897 a 9 de julho de 1999 (intendente eleito); Antônio Crispim de Souza, de 9 de junho de 1899 a 24 de fevereiro de 1902 (intendente eleito); Moisés Augusto de Sant”Ana, de 24 de fevereiro de 1902 a dezembro de 1902 (presidente do Conselho, logo após a renúncia do titular): Antônio de Souza Ramos, de dezembro 1902 a 1º. de novembro de 1903 (presidente do Conselho Municipal); Américo Borges de Carvalho, de 1º. de novembro de 1903 a 1º. de novembro de 1907 (último intendente eleito até a emancipação política e a adoção do nome Anápolis).
INTEDENTES APÓS A EMANCIPAÇÃO
O primeiro administrador de Anápolis eleito após a emancipação foi Joaquim Prudêncio Baptista, que governou de 1º de novembro de 1907 a 1º de novembro de 1911 (intendente eleito); Manuel Francisco d”Abadia, de 1º de novembro de 1911 a 1913 (intendente eleito renunciou no mesmo ano); Luiz Inácio de Bastos, de 1913 a 2 de fevereiro de 1914 (era 2º vice-intendente e assumiu provisoriamente); Pedro Alexandrino da Costa, de 2 de fevereiro de 1914 a 1º de novembro de 1915 (era 3º vice-intendente e assumiu com renúncia do 2º vice). Cristóvão Campos, de 1º de novembro de 1915 a 1º de novembro de 1918 (intendente eleito); Odorico da Silva Leão, de 1º de novembro de 1918 a outubro de 1919 (intendente eleito); Braz Luiz Gomes de Pina, de outubro de 1919 a outubro de 1920 (1º vice assumiu com a licença de Odorico da Silva Leão); Pacífico Alves da Cruz, de outubro de 1920 a dezembro de 1921 (eleito após a morte de Braz Luiz Gomes de Pìna); Graciano Antônio da Silva, de dezembro de 1921 a março de 1922 (presidente do Conselho, assumiu após a renúncia de Pacífico); Odorico da Silva Leão, de março de 1922 a 1º de novembro de 1922 (último intendente a administrar Anápolis).
PREFEITOS A PARTIR DE 1922
A era dos prefeitos foi iniciada em 1º de novembro de 1922, com a eleição de Graciano Antônio da Silva, que governou Anápolis até 1º de novembro de 1926; Adalberto Pereira da Silva, de 1º novembro de 1926 a 8 de novembro de 1930 (prefeito eleito); João Luiz de Oliveira, de 8 de novembro de 1930 a março de 1934 (prefeito nomeado pelo governo do estado); Irani Alves Ferreira, de março de 1934 a dezembro de 1934 (prefeito nomeado pelo governo do estado); José Fernandes Valente, de dezembro de 1934 a outubro de 1936 ( prefeito eleito mas teve seu mandato cassado pelo Estado Novo).
PREFEITOS DE 1936 A 1947
De 1936 a 1947, Anápolis teve 10 prefeitos nomeados pelo governo do estado: Elizeu Jorge Campos, de outubro de 1936 a dezembro de 1936; José Fernandes Valente, de dezembro de 1936 a 12 de julho de 1940; Manoel Demóstenes Barbo de Siqueira, de 12 de julho de 1940 a 14 de maio de 1943; Joaquim Câmara Filho, de 15 de maio de 1943 a 23 de março de 1945; Graciano Antônio da Silva, de 23 de março de 1945 a 12 de novembro de 1945; José do Couto Dafico, de 12 de novembro de 1945 a março de 1946; Plínio Abadia Gonzaga Jayme, de março de 1945 a março de 1946; Graciano Antônio da Silva, de outubro de 1946 a 31 de março de 1947; Adahyl Lourenço Dias, de 31 de março de 1947 a 31 de outubro de 1947; Balthazar dos Reis, de 1º de novembro de 1947 a 8 de dezembro de 1947.
PREFEITOS DE 1947 A 1973
Empossado em 8 de dezembro de 1947, Carlos de Pina governou até 31 de janeiro de 1951; Plácido Campos, presidente da Câmara assumiu interinamente em 31 de janeiro de 1951 e permaneceu no cargo de prefeito por apenas 10 dias (até 10 de fevereiro); Sócrates Mardocheu Diniz assumiu em 10 de fevereiro de 1951 e governou até 31 de janeiro de 1953, quando renunciou ao cargo; Plácido de Campos, presidente da Câmara Municipal, ocupou a prefeitura como interino, mais uma vez, até 1º de maio de1953; João Luiz de Oliveira foi eleito para concluir o mandato de Sócrates Diniz, de 1º de maio de 1953 a 31 de janeiro de 1955.
Carlos de Pina foi eleito para mais um mandato, de 31 de janeiro de 1955 a 31 de janeiro de 1959, quando assumiu Heli Alves Ferreira, eleito para administrar o município até 31 de janeiro de1963. Desta data até 31 de janeiro de 1966, Anápolis foi governada pelo prefeito eleito Jonas Ferreira Alves Duarte, que passou o cargo para Raul Balduíno de Souza, prefeito de 31 de janeiro de 1966 a 31 de janeiro de 1970. O seu sucessor foi Henrique Antônio Santillo, cujo mandato se estendeu de 1º de janeiro de 1970 a 31 de janeiro de 1973. Empossado em 31 de janeiro de 1973, o prefeito eleito José Batista Júnior foi cassado pela Ditadura Militar em 28 de agosto do mesmo ano, quando iniciou-se um período de oito nomeações.
NOMEADOS DE 1973 A 1986
Durante a intervenção federal Anápolis teve nove prefeitos nomeados: Irapuan Costa Júnior, de 29 de agosto de 1973 a 15 de maio de1974; Eurípedes Barsanulfo Junqueira, de 15 de maio de 1974 a 8 de abril de 1975; Jamel Cecílio, de 9 de abril de 1975 a 19 de abril de 1978; Lincoln Gomes de Almeida, de 20 de abril de 1978 a 26 de março de 1979; Decil de Sá Abreu,de 27 de março de 1979 a 24 de março de 1980; Wolney Martins de Araújo, de 24 de março de 1980 a 15 de maio de 1982, quando assumiu o presidente da Câmara Municipal Fernão Ivan José Rodrigues. Ele ficou apenas 20 dias no cargo. Olímpio Ferreira Sobrinho tomou posse no dia 4 de junho de 1982 e governou o município até 29 de dezembro de 1983. Nesse dia assumiu Anapolino de Faria, o último prefeito nomeado, cujo mandato expirou-se em 31 de dezembro de 1986.
PREFEITOS APÓS 1986
Após a volta das eleições registraram-se 11 alternâncias no cargo: Adhemar Santillo, de 1º de janeiro de 1986 a 1º de janeiro de 1990; Anapolino de Faria, de 1º de janeiro de 1989 a 1º de janeiro de 1993; Wolney Martins de Araújo, de1º janeiro de 1993 a 1º janeiro de 1997; Adhemar Santillo, de 1º de janeiro de 1997 a 31 de janeiro de 2001; Ernani José de Paula, de 1º de janeiro de 2001 a 19 de agosto de 2003, data em que foi cassado pela Câmara Municipal; no dia 20 assumiu Alcides Rodrigues Filho, interventor nomeado pelo governo do estado. Ele permaneceu no cargo até o dia 30 de novembro daquele ano, dia da posse do vice-prefeito eleito Pedro Fernando Antônio Sahium, que completou o mandato de Ernani de Paula, em 1º de janeiro de 2005. Eleito, Pedro Sahium permaneceu prefeito até 1º de 2009. Antônio Roberto Gomide cumpriu seu primeiro mandato de 1º de janeiro de 2009 a 1º de janeiro o de 2013: reeleito, continuou prefeito até 4 de abril de 2014, quando renunciou para disputar o governo do estado, transmitindo o cargo para o vice João Gomes Pinto, atual administrador de Anápolis.
As eleições 2016 para prefeito e vereadores estão marcadas para 2 de outubro (primeiro turno) e 30 de outubro (segundo turno).